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Evaluación de tres métodos de extracción de ARN de Candida albicans (cepa de referencia IP 118079)

El presente estudio consistió en la evaluación de tres métodos de extracción de ARN a partir de una cepa de referencia del hongo patógeno oportunista Candida albicans, ya que en este microorganismo el aislamiento de esta biomolecula, constituye una de las principales limitaciones debido a los compon...

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Institution:Universidad del Quindío
Main Authors: Cruz Pérez, Diana Carolina, Gómez Marín, Jorge Enrique
Format: Trabajo de grado - Pregrado
Language:Español
Published: Facultad de Ciencias Básicas y Tecnologías 2009-05-27
Subjects:
Candida albicans
Métodos de extracción
Extracción de ARN
Online Access:https://bdigital.uniquindio.edu.co/handle/001/5951
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spelling Gómez Marín, Jorge Enrique
Cruz Pérez, Diana Carolina
2021-02-01T21:03:34Z
2021-02-01T21:03:34Z
2009-05-27
https://bdigital.uniquindio.edu.co/handle/001/5951
071903
El presente estudio consistió en la evaluación de tres métodos de extracción de ARN a partir de una cepa de referencia del hongo patógeno oportunista Candida albicans, ya que en este microorganismo el aislamiento de esta biomolecula, constituye una de las principales limitaciones debido a los componentes de su pared celular, por lo tanto los estudios a nivel genético y molecular son limitados en esta levadura. Se realizaron 12 extracciones para cada uno de los protocolos y a través de espectrofotometría y electroforesis en agarosa se determino la concentración, presencia y pureza de la muestra de ARN
1. Introducción 2 2. Marco teórico 4 2.1. Genero candida 4 2.2. Candida albicans 4 2.3. Acido ribonucleico 6 2.4. Diferentes tipos de ARN 7 2.5. Características físico-químicas del ARN 9 3. Planteamiento del problema 11 4. Justificación 12 5. Antecedentes 13 6. Objetivos 17 7. Materiales y métodos 18 7.1. Organismo y condiciones de cultivo 18 7.2. Cuantificación del número de células presentes en la muestra 18 7.3. Lisis de la pared celular 19 7.4. Extracción de ARN total 20 7.4.1. Método casero Fenol-cloroformo-isoamilico 20 7.4.2. Estuche comercial SV Total RNA Isolation System promega 20 7.4.3. Reactivo trizol 21 7.5. Cuantificación del ARN total y determinación de la pureza 22 7.6. Purificación del ARN total 22 7.7. Visualización del ARN total mediante electroforesis en gel de agarosa 22 7.8. Determinación de contaminación de ADN en las muestras de ARN total 23 8. Resultados 24 8.1. Cuantificación del número de células presentes en la muestra 24 8.2. Lisis de la pared celular 24 8.3. Extracción de ARN total 24 8.4. Cuantificación del ARN total y determinación de la pureza 25 8.5. Purificación del ARN total 26 8.6. Visualización del ARN total mediante electroforesis en gel de agarosa 27 8.7. Determinación de contaminación de ADN en las muestras de ARN total 27
Pregrado
Biólogo
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Derechos reservados Universidad del Quindío
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Atribución-NoComercial 4.0 Internacional (CC BY-NC 4.0)
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Evaluación de tres métodos de extracción de ARN de Candida albicans (cepa de referencia IP 118079)
Trabajo de grado - Pregrado
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Candida albicans
Métodos de extracción
Extracción de ARN
1. Firon Arnaud and d’Enfert Christophe. Identifying essential genes in fungal pathogens of humans. TRENDS in Microbiol Vol.10 No.10 review. 2002. pp. 456- 462.
2. Okeke Charles N., Tsuboi ryoji, and Ogawa Hideoki. Quantification of Candida albicans Actin mRNA by the LightCycler System as a Means of Assessing Viability in a Model of Cutaneous Candidiasis. J. of clin. Microbiol. Vol. 39, No. 10. 2001. pp. 3491–3494
3. Kolla´r R, Reinhold BB, Petra´kova´ E, Herman J C, Yehi, Ashwell G, Drgonova J, Kapteyn J C, Klis F M, Cabib E. Architecture of the yeast cell wall β(1→3)-d-glucan, interconnects mannoprotein, β(1→6)-d-glucan, and chitin. 272, 28. 1997. pp. 17762– 17775.
4. Chaffin w. Lajean, López-ribot José Luis, Casanova Manuel, Gonzalbo Daniel, and Martínez José p. Cell wall and secreted proteins of candida albicans: identification, function, and expression microbiology and molecular biology reviews. vol. 62, No 1. 1998. pp. 130–180.
5. Etiènne-Decant Jacqueline, Françoise Millot, Elena (trad.) Alhaja Prez, Elena. Bioquímica genética, biología molecular Publicado por Elsevier España. 2001. http://books.google.com.co/books?id=33GIdnSf56oC&pg=PA3&dq=acidos+nucleicos .
Facultad de Ciencias Básicas y Tecnologías
Armenia
Ciencias Básicas y Tecnologías - Biología
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title Evaluación de tres métodos de extracción de ARN de Candida albicans (cepa de referencia IP 118079)
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Cruz Pérez, Diana Carolina
Gómez Marín, Jorge Enrique
Cruz Pérez, Diana Carolina
Candida albicans
Métodos de extracción
Extracción de ARN
1. Introducción 2 2. Marco teórico 4 2.1. Genero candida 4 2.2. Candida albicans 4 2.3. Acido ribonucleico 6 2.4. Diferentes tipos de ARN 7 2.5. Características físico-químicas del ARN 9 3. Planteamiento del problema 11 4. Justificación 12 5. Antecedentes 13 6. Objetivos 17 7. Materiales y métodos 18 7.1. Organismo y condiciones de cultivo 18 7.2. Cuantificación del número de células presentes en la muestra 18 7.3. Lisis de la pared celular 19 7.4. Extracción de ARN total 20 7.4.1. Método casero Fenol-cloroformo-isoamilico 20 7.4.2. Estuche comercial SV Total RNA Isolation System promega 20 7.4.3. Reactivo trizol 21 7.5. Cuantificación del ARN total y determinación de la pureza 22 7.6. Purificación del ARN total 22 7.7. Visualización del ARN total mediante electroforesis en gel de agarosa 22 7.8. Determinación de contaminación de ADN en las muestras de ARN total 23 8. Resultados 24 8.1. Cuantificación del número de células presentes en la muestra 24 8.2. Lisis de la pared celular 24 8.3. Extracción de ARN total 24 8.4. Cuantificación del ARN total y determinación de la pureza 25 8.5. Purificación del ARN total 26 8.6. Visualización del ARN total mediante electroforesis en gel de agarosa 27 8.7. Determinación de contaminación de ADN en las muestras de ARN total 27
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language Español
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description El presente estudio consistió en la evaluación de tres métodos de extracción de ARN a partir de una cepa de referencia del hongo patógeno oportunista Candida albicans, ya que en este microorganismo el aislamiento de esta biomolecula, constituye una de las principales limitaciones debido a los componentes de su pared celular, por lo tanto los estudios a nivel genético y molecular son limitados en esta levadura. Se realizaron 12 extracciones para cada uno de los protocolos y a través de espectrofotometría y electroforesis en agarosa se determino la concentración, presencia y pureza de la muestra de ARN
contents 1. Introducción 2 2. Marco teórico 4 2.1. Genero candida 4 2.2. Candida albicans 4 2.3. Acido ribonucleico 6 2.4. Diferentes tipos de ARN 7 2.5. Características físico-químicas del ARN 9 3. Planteamiento del problema 11 4. Justificación 12 5. Antecedentes 13 6. Objetivos 17 7. Materiales y métodos 18 7.1. Organismo y condiciones de cultivo 18 7.2. Cuantificación del número de células presentes en la muestra 18 7.3. Lisis de la pared celular 19 7.4. Extracción de ARN total 20 7.4.1. Método casero Fenol-cloroformo-isoamilico 20 7.4.2. Estuche comercial SV Total RNA Isolation System promega 20 7.4.3. Reactivo trizol 21 7.5. Cuantificación del ARN total y determinación de la pureza 22 7.6. Purificación del ARN total 22 7.7. Visualización del ARN total mediante electroforesis en gel de agarosa 22 7.8. Determinación de contaminación de ADN en las muestras de ARN total 23 8. Resultados 24 8.1. Cuantificación del número de células presentes en la muestra 24 8.2. Lisis de la pared celular 24 8.3. Extracción de ARN total 24 8.4. Cuantificación del ARN total y determinación de la pureza 25 8.5. Purificación del ARN total 26 8.6. Visualización del ARN total mediante electroforesis en gel de agarosa 27 8.7. Determinación de contaminación de ADN en las muestras de ARN total 27
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